Το Εργαστήριο Μουσικής Παιδαγωγικής ιδρύθηκε τον Φεβρουάριο του 2016 (ΦΕΚ 441/24-2-2016, Τεύχος Δεύτερο).

Διευθύντρια του Εργαστηρίου είναι η Καθηγήτρια του Τμήματος Σμαράγδα Χρυσοστόμου.